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基因组提取 (酚氯仿法)

来源:一二三四网
定位克隆实验室 2010-12-27 胡文波修订

酚氯仿提基因组-大量高纯度DNA的制备

原理:

酚、氯仿是蛋白质变性剂,能有效去除核蛋白,使核酸从核蛋白中分离出来。氯仿还能加速有机相与液相的分层,少许异戊醇能稳定界面,减少蛋白质变性过程中产生气泡。

操作步骤:

1. 将材料放入预冷的

研钵中,加入液氮后迅速研磨成粉末状(刚加入液氮时不停上下锤击材料,液氮快挥发完时用研棒旋转搅拌挤压材料使之破碎)。

2.

800ul抽提缓冲液,轻轻摇匀,形成匀浆状。

研磨完毕后,加入

3. 将匀浆液转移至1

个2ml离心管中,加入Proteinase K至终浓度为100ug/ml(800ul加4ul蛋白酶K(20ug/ul)),55℃水浴保温过夜。

4.

酚,室温温和振荡,摇匀,10-15min。

加入等体积平衡

5.

4℃ 10min,将粘稠的水相移至洁净的离心管中。

离心:12000rpm

6.

再用酚:氯仿(v:v

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=1:1),氯仿各抽提1次(离心:12000rpm 4℃ 10min)。

7. 将上层水相移至洁

净的离心管中,加入2倍体积无水乙醇,转动离心管使溶液充分混合,DNA立即形成沉淀。

8. 离心:7500g 4℃

10min,使DNA沉于管底,将离心管倒置于滤纸上,晾干(或用玻璃棒/消毒牙签将DNA沉淀从乙醇沉淀中移出)。

9.

DNA沉淀2次(离心:7500g 4℃ 10min)。

用70%乙醇洗涤

10.

TE(pH8.0)使DNA完全溶解。

加入200ul

11.

浓度为50ug/ml,37℃保温1h。

加入RNase至终

12.

测DNA的浓度和纯度。

紫外分光光度计检

13. 为1000ng/ul。

调节DNA终浓度

14.

将DNA做梯度稀

释:1×102 ,1×101 ,1×100 ,1×10-1 ,1×10-2 ng/ul,稀释体积为100ul。

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15. 取2ul DNA与2ul

2×上样缓冲液混匀,点样到琼脂糖凝胶(w/v = 2%)中,以2.5-5v/cm电泳。

16.

色约15min,UV灯下观察拍照。

17.

DNA做模板进行RPL3的PCR,电泳检测。

0.5ug/ml EtBr染

分别取4ul基因组

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